2006年，历经10年的医疗改革，最终被认为“基本失败”。
从年初到年末，药价虚高、商业贿赂、假药致死、高官落马，医药领域的丑闻“按下葫芦起来瓢”。其“病灶”即在这里。庆幸的是，临近年末，牵动人心的新医改方案，终于有了明确出台时间表。据称，新方案将于2007年6月份出台。新方案将“努力保证人民公平享有基本卫生保健”，并确立“建设覆盖城乡居民的不同形式的医疗保险制度”。
官员落马源于10年前的那场医改，最终将关乎民生的医疗行业推向了市场。数年间，被推向市场的药价节节攀升。国家发改委先后20次发文降低药价。仅2006年就降价3次，但收效甚微。统计数据显示，国家前18次药品降价，只使全国百姓每人每年买药支出减少了2.5元。根据国家现行规定，只有政府定价以外的药品才由经营者自行定价。因此，拿到了“新药”指标就等于获得了单独定价的权力。当老药进入《国家基本医疗保险药品目录》，制药商立即将其摒弃，用“换名不换药”但价格却高出几倍甚至几十倍的“新药”将其替代。2006年，潜在的“新药利益链”，最终引爆数名医药官员落马。他们是国家食品药品监督管理局医疗器械司司长郝和平、国家药监局药品注册司司长曹文庄，药监局助理巡视员、原药品注册司化学药品处处长卢爱英，以及国家药典委员会常务副秘书长王国荣。
2006年5月22日，中国医疗卫生发展报告课题组，推出了2006年《医疗卫生绿皮书》。绿皮书认为，中国10年医改，确实造成了医疗服务的公平性下降，以及卫生投入的宏观效率低下等诸多问题。另外，医改带来的另一个副作用，是药品质量的下滑。案例出现在2006年5月。齐齐哈尔第二制药有限公司，在制药过程中用廉价的二甘醇代替丙二醇，最终导致9人死亡。这是近年来国内众多假药案中导致死亡人数最多的一例。无独有偶。2个月后，青海、广西、浙江、黑龙江和山东等省，又陆续有部分患者，因使用安徽华源生物药业公司的注射液“欣弗”后，出现严重不良反应，并造成11人死亡。事后查明，安徽华源生物药业有限公司未按规定灭菌、违规生产是导致事件的主要原因。所幸的是，医疗领域反商业贿赂行动，到了年底也没有被放松。统计资料显示，在全国药品行业中，仅药品回扣一项，每年要侵吞国家资产约7.72亿元，约占全国医药行业全年税收收入的16%。
卫生部、国家中医药管理局，于12月中旬发出通知，要求建立防控医药购销领域商业贿赂的长效机制，建立行贿企业黑名单制度。并强调，
医院存在乱收费、私设“小金库”等行为，将严究院长责任。10月23日，在主持主持中央政治局第35次集体学习时，国家主席胡锦涛强调，要坚持公共医疗卫生的公益性质，深化医疗卫生体制改革，建设覆盖城乡居民的基本卫生保健制度，为群众提供安全、有效、方便、价廉的公共卫生和基本医疗服务。
