今日起，中国建设银行将在大型商业银行中率先正式对通存通兑业务收费。不过，工商银行、农业银行、中国银行以及交通银行等银行人士则表示，“暂时并未收到总行的通知”。在收费标准上，建行表示，客户办理跨行通存通兑业务时，建行作为代理行时将向客户收取手续费，作为开户行时不向客户收取手续费。手续费同城和异地执行同一标准，按金额的1%收取，每笔最低10元，最高200元。跨行账户信息查询费暂不收取。
小额支付系统跨行通存通兑业务19日起在全国范围内开通，但此前已经开通此项业务的各家大型商业银行网点仅处于试运行状态，只是公布了收费的标准，并未正式实施收费。兴业银行等部分中小银行则已开始收费。
目前通存通兑业务多数银行均收取每笔业务金额的1%，最低1元最高100元是主流，也有银行最低收5元或10元最高200元；中行最低1元，最高100元；工行最低10元，最高要等总行进一步确定。
之所以会出现手续费率的不同，是因为根据央行的要求，目前通存通兑业务收费实行的是商业银行根据市场自行定价，人民银行各分支机构无权统一。
但这一快捷便利的业务的收费以及收费标准一开始就备受争议。北京市消费者协会秘书长张明日前就直指跨行通存通兑收费过高，涉嫌垄断经营，侵害了消费者的公平交易权。北京市律师协会消费者权益保护专业委员会主任邱宝昌认为，跨行通存通兑是否需要收费、需要收多少费，应由银监会先行调查了解，确定标准后进行听证，最后上报价格主管部门审批，而不应该由银行说了算。 见习记者 王涛
